circRNA整体解决方案
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发布时间: 2025天前
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环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子(在活体中有时也有表达),是RNA领域*新的研究热点。与传统的线性RNA(linear,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈闭环结构,不受RNA外切酶影响,表达更稳定,不易降解。在功能上,今年的研究表明,circRNA分子富含microRNA(miRNA)结合位点,在细胞中起到miRNA海绵(miRNA sponge)的作用,进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表达水平,这一作用机制被称为竞争性内源(ceRNA机制)。通过与疾病关联的miRNA相互作用,circRNA在疾病中发挥着重要的调控作用。
特征与功能:
环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子(在活体中有时也有表达),是RNA领域*新的研究热点。与传统的线性RNA(linear,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈闭环结构,不受RNA外切酶影响,表达更稳定,不易降解。在功能上,今年的研究表明,circRNA分子富含microRNA(miRNA)结合位点,在细胞中起到miRNA海绵(miRNA sponge)的作用,进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表达水平,这一作用机制被称为竞争性内源(ceRNA机制)。通过与疾病关联的miRNA相互作用,circRNA在疾病中发挥着重要的调控作用。
成环机制:
circRNA环化方式分为内含子环化和外显子环化,目前主流的成环机制可归类成三种:
1.依赖于剪切体的索尾插接环化;
2.顺式作用元件促进circRNA形成;
3.RNA结合蛋白(RBPs)调控cicRNA形成。
生物学功能:
circRNA主要存在于细胞质或外泌体中,具有组织特异性、疾病特异性、时序特异性及高稳定性等特征。近几年,大量的研究表明circRNA在生物的生长发育、胁迫应答、疾病发生和发展等方面密切相关,并预测其在疾病诊断标记物等方面的应用前景,但其生物学功能在很大程度上仍然未知。目前认可度比较高的circRNA生物学功能,归类如下:
1.miRNA sponge。circRNA富含miRNA结合位点来充当miRNA海绵作用,阻止miRNA在3’UTR与mRNA相互作用,进而间接调控miRNA下游靶基因的表达;
2.调控蛋白结合。cicRNA通过与mRNA调节的结合蛋白(RBP)结合,进而改变剪接模式或mRNA稳定性;
3.调控基因转录。circRNA与RNA聚合酶相互作用并调节转录,或者circRNA可与小核糖核蛋白相互作用,再与RNA聚合酶结合;
4.编码功能。circRNA虽然属于非编码RNA,但也有部分circRNA可被核糖体翻译并编码多肽,进而行使调控功能。
circRNA研究思路:
客户提供:
临床标本,例如肿瘤组织、癌旁组织和正常组织等。